Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf50Q5SZB4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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C9orf50Q5SZB4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf50Q5SZB4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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