Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITRM1Q5JRX3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms