Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms