Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms