Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A12Q504Y0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A12Q504Y0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms