Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF3Q496Y0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms