Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms