Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms