Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTLL9Q3SXZ7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTLL9Q3SXZ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms