Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD55Q3KP44 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms