Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBPF1Q3BBV0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF1Q3BBV0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms