Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms