Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL40Q2TBA0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms