Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VWC2Q2TAL6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VWC2Q2TAL6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VWC2Q2TAL6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms