Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC57Q2TAC2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms