Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPHKAPQ2M3C7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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