Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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