Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME3Q16798 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME3Q16798 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME3Q16798 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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