Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC37Q16543 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC37Q16543 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms