Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F4Q16254 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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