Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms