Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETFDHQ16134 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETFDHQ16134 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms