Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZFHX3Q15911 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZFHX3Q15911 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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