Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN9AQ15858 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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