Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIP4Q15650 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIP4Q15650 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms