Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SURF2Q15527 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms