Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK1Q15118 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms