Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCF4Q15080 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms