Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms