Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RFTN1Q14699 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFTN1Q14699 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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