Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms