Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4AQ14139 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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UBE4AQ14139 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4AQ14139 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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