Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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