Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA4Q13772 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms