Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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