Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1SQ13698 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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