Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF5Q13568 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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