Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF4EBP1Q13541 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EIF4EBP1Q13541 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms