Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C1orf61Q13536 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1orf61Q13536 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms