Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IKZF1Q13422 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IKZF1Q13422 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IKZF1Q13422 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IKZF1Q13422 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IKZF1Q13422 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IKZF1Q13422 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms