Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms