Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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