Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAF1AQ13111 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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