Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRDM2Q13029 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
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