Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms