Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANK3Q12955 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms