Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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