Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRAF2Q12933 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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