Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-17■■■□□ 19
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ILF3Q12906 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.577e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-206ENST00000468705 484 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-205ENST00000465438 4253 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.987e-17■■■□□ 19
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ILF3Q12906 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 19
ILF3Q12906 PIP5K1A-201ENST00000349792 3767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.691e-6■■■□□ 19
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ILF3Q12906 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.446e-7■■■□□ 19
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ILF3Q12906 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.326e-6■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 54.62□□□□□ -1.674e-7■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-6■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 18.9
ILF3Q12906 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.318e-8■■■□□ 18.9
ILF3Q12906 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-8■■■□□ 18.9
ILF3Q12906 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 59.48□□□□□ -0.896e-11■■■□□ 18.9
ILF3Q12906 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.426e-11■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.461e-7■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.051e-7■■■□□ 18.9
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ILF3Q12906 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-8■■■□□ 18.8
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ILF3Q12906 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-6■■■□□ 18.8
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ILF3Q12906 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.357e-7■■■□□ 18.8
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ILF3Q12906 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 47.81□□□□□ -1.167e-7■■■□□ 18.8
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ILF3Q12906 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.387e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.487e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.677e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 ARIH2-229ENST00000495507 112 ntTSL 52.71□□□□□ -1.989e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 524.33■■□□□ 1.495e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 321.04■□□□□ 0.965e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 518.99■□□□□ 0.635e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 515.64■□□□□ 0.095e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 47.31□□□□□ -1.245e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 53.19□□□□□ -1.95e-9■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-6■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.614e-6■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 NFIC-205ENST00000588839 625 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-6■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TADA3-205ENST00000492103 1868 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-6■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TEAD4-207ENST00000543035 801 ntTSL 525.82■■□□□ 1.721e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■□□ 18.8
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