Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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